Мультфильм «заморозка» рассказывает о том, что будет происходить на Земле в будущем, которое ожидается мрачным. Скоро на планету начнут нашествие ангелоподобные пришельцы, которых называют Нова. Противостоять им смогут только генетически модифицированные девушки. Их называют Пандорами. Особенность таких девушек в том, что в их тела вживили споры одной субстанции «стигма», которая была создана на основе генома пришельцев.
Пандоры тренируются в специальной военной академии, в которую собирают кандидаток со всей планеты. Здесь девушек учат при помощи силы мысли вызывать свое оружие и доспехи, чтобы потом задействовать их в бою. В академии царят суровые порядки и жесткая иерархия. Девушки постоянно сражаются между собой, что позволяет им подниматься на порядок выше. Так странно формируются будущие защитницы Земли, которые чаще думают о том, как подставить соперницу, а не о том, чтобы спасти мир. Однако репутация дает дополнительные привилегии ученицам.
Но победить Нова Пандора сможет только в том случае, если ей поможет парень, обладающий способностью к «заморозке», т.е. остановке пришельца. Пандора и такой парень заключают контракт, для которого необходимы эмоциональная привязанность и единение. К чему же приведет такая тесная связь?