Все действия происходят в придуманном мире, в котором сегунат Токугава свое правление осуществляет уже много веков. За окном уже двадцать первый век, Япония полностью изолирована от всего мира, а студенческим советом в Академии, где учатся потомки богатых кланов, железная рука карает всех непослушных властям и Девушки-самураи, представлены главными героинями сюжета.