В этом сезоне более глубоко раскрываются личности персонажей и их взаимоотношений. Эми прекращает выступать в роли «гулящей» и в первой же серии заводит постоянного парня ― Кифа. Впечатляют серии «Потерянные паразиты» и «Сказка о потерянном времени», которые показывают, насколько сильно и глубоко Фрай любит инопланетянку Лилу и на какие поступки он готов, лишь бы добиться ее расположения.
В серии «Компьютерный дом ― это круто» Лилу практически полностью от комплекса, связанного с наличием всего одного глаза. Она начинает искренне гордиться своей уникальностью и индивидуальностью.
Но в «Футурама. Третий сезон» не только рассказывает о приключениях старых героев, она знакомит с новыми персонажами. Среди них жаба-гипнотизер и злые огромные космические мозги. Последние искренне терпеть не могут чужие мысли и стараются разрушить абсолютно все разумные миры. Эта опасность становится новым испытанием для Фрая, поскольку победить космическую угрозу может только он.
Много интересного расскажет третий сезон о семье «путешественника во времени по неволе», которая, в отличие от него, осталась в двадцатом веке. Покажет, насколько же сильно Зойдберг любит комедию и мечтает стать комиком. Раскроет тайну ужасного Санта Клауса, приоткроет завесу истории 1947 года и познакомимся с Марксом. Также «Футурама. Третий сезон» докажет, что высший разум, все же, существует.